名前	菅谷　勇樹
	所属	基礎理工学専攻/数理科学専修
	研究分野	バイオインフォマティクス/連鎖解析

私は，疾患の原因遺伝子の場所をより正確に見つけることを目的に研究を行なっています．疾患遺伝子の探索問題に対しては，既に家系図を用いた連鎖解析と呼ばれる手法が確立していますが，私の研究もこの範ちゅうになります．
連鎖解析では，家系図データ（家系内の各個人の疾患の有無とマーカー遺伝子の遺伝子型データ）を観察データとし，原因遺伝子とマーカー遺伝子との間の組み換え確率をパラメータとみなした尤度を計算します．組み換え確率はマップ関数により遺伝子間の距離と対応付けることができるため，組み換え確率の最尤推定量を求めることで原因遺伝子の場所の推定が可能になります．
私は，家系図データから効率よく尤度を計算することができる"確率継承アルゴリズム"を提案しています．このアルゴリズムにより，これまで不可能であった大家系，多マーカー家系に対しても尤度の計算が実現可能になると期待されます．さらには，組み換え確率の確率モデルを構築することで遺伝子間の物理的距離を推定することができるようになりました．
また，近年のゲノム研究のより利用可能になった大量のゲノムデータを正しく扱うことも研究興味のひとつであり，実際にアイスランドの家系データに対してデータを選別し，私の提案する手法を適用することで有益な結果を得ています．
現在は既存の手法と効率性の比較行なっているところであり，疾患原因遺伝子のより正確な推定を目指しています．